HOWTO · R
R の Ggplot2 に信頼区間を追加する
このチュートリアルでは、R で ggplot2 に信頼区間を追加する方法を示します。
ggplot2 ライブラリは、さまざまなグラフをプロットするために使用されます。 geom_smooth() または geom_ribbon() メソッドを使用して、信頼区間の線またはバンドをプロットに追加できます。
このチュートリアルでは、R で ggplot2 に信頼区間を追加する方法を示します。
R の ggplot2 に信頼区間を追加する
まず、ggplot2 をプロットするデータ フレームを作成する必要があります。
コード例:
x <- 1:80
y <- rnorm(80) + x / 8
low <- y + rnorm(80, - 2, 0.1)
high <- y + rnorm(80, + 2, 0.1)
data_frame <- data.frame(x, y, low, high)
head(data_frame)
上記のコードは、80 行と 4 列のサンプル データ フレームを作成します。 x と y はプロットされる値で、値 high と low はそれらの値の信頼区間です。
データ フレームの先頭であるコードの出力を参照してください。
x y low high
1 1 0.7819640 -1.29439898 2.719669
2 2 0.8893052 -1.09524369 2.885744
3 3 1.8762126 0.03061524 3.910596
4 4 -0.3713966 -2.34534103 1.683949
5 5 1.9099850 -0.04985367 4.026922
6 6 1.2793110 -0.82542732 3.199673
次のステップは、ggplot2 をプロットすることです。 しかし、まず、ggplot2 パッケージをインストールしてロードする必要があります。
install.packages("ggplot2")
library("ggplot2")
パッケージが読み込まれると、ggplot をプロットできます。
gg_plot <- ggplot(data_frame, aes(x, y)) +
geom_point()
gg_plot
上記のコードは、グラフをプロットします。
geom_smooth() または geom_ribbon() メソッドを使用して、最終的に信頼区間を ggplot2 に追加できます。
geom_smooth() メソッドを使用して信頼区間の線を追加します。
## Add confidence interval lines
gg_plot + geom_smooth(aes(ymin = low, ymax = high), alpha = 0.2)
geom_ribbon() メソッドを使用して信頼区間バンドを追加します。
完全なサンプルコード
このチュートリアルで使用する完全なサンプル コードを次に示します。
x <- 1:80
y <- rnorm(80) + x / 8
low <- y + rnorm(80, - 2, 0.1)
high <- y + rnorm(80, + 2, 0.1)
data_frame <- data.frame(x, y, low, high)
head(data_frame)
install.packages("ggplot2")
library("ggplot2")
gg_plot <- ggplot(data_frame, aes(x, y)) +
geom_point()
gg_plot
## Add confidence interval lines
gg_plot + geom_smooth(aes(ymin = low, ymax = high), alpha = 0.2)
## Add confidence interval bands
gg_plot + geom_ribbon(aes(ymin = low, ymax = high), alpha = 0.2)
